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育種加速器-實(shí)現(xiàn)快速育種的終極利器 日期:2023-02-14 14:18:42 / 來源:上蔬源

作為農(nóng)業(yè)的“芯片”,種子是保障糧食安全和農(nóng)產(chǎn)品有效供給的重要基礎(chǔ)。今年的中央一號文件中就明確提出,要將抓好糧食生產(chǎn)和重要農(nóng)產(chǎn)品供給擺在首要位置。但由于育種規(guī)模不斷擴(kuò)大,傳統(tǒng)的育種方式逐漸無法滿足市場的需求,而育種加速器作為未來大數(shù)據(jù)時(shí)代的育種新興載體和科技手段也就此應(yīng)運(yùn)而生。


與傳統(tǒng)育種相比,育種加速器具有檢測速度更快、成本更低、通量更大等特點(diǎn),能夠更高效地對更多植株進(jìn)行基因檢測和反饋?,F(xiàn)代農(nóng)業(yè)育種的一個(gè)主要方向就是性狀改良,以獲得更大的果實(shí)/種子,更高的含油量(油料作物),更發(fā)達(dá)的根系等,育種加速器可以快速獲取大量植物表型信息,通過基因編輯完成種子的優(yōu)勝劣汰。

育種加速器的定義


育種加速器主要由基因編輯植物工廠系統(tǒng)集成高通量植物表型平臺三大功能構(gòu)成。通過高通量植物表型平臺對植物生長的觀測和性狀分析,以基因組技術(shù)對植株進(jìn)行基因編輯,形成分子層面的選擇、回交育種、雜交種純度檢驗(yàn)等,打造出特定的基因芯片,并以植物工廠的系統(tǒng)集成為載體,達(dá)到育種加速、更新迭代的目的,實(shí)現(xiàn)作物的周年生產(chǎn)。


在育種加速器中,科研人員將大規(guī)?;蚪M測序和植物表型信息相結(jié)合,構(gòu)建服務(wù)于育種的基因組技術(shù)工具——基因芯片。通過整合表型大數(shù)據(jù)與基因組大數(shù)據(jù),科研人員能夠發(fā)現(xiàn)基因組分子標(biāo)記和田間表現(xiàn)的關(guān)聯(lián),再運(yùn)用自動化的種子切片技術(shù),在實(shí)驗(yàn)室即可在大量材料中篩選出最優(yōu)品種從而形成迭代,大大減少田間的工作和花費(fèi)。


*植物工廠技術(shù)應(yīng)用于育種栽培的作物有葉菜、茄果、瓜果、藥用植物、花卉、果樹、玉米及經(jīng)濟(jì)作物(如水稻、小麥、大豆、油菜、棉花等)

通過對作物DNA的測序和分析,改造、定制標(biāo)準(zhǔn)化的基因芯片,形成基因大數(shù)據(jù)庫,針對不同市場、不同人群培育出滿足(如節(jié)水抗旱、抗蟲害、抗除草劑、耐堿、高肥效、高產(chǎn)等)不同特性的種子,最終形成企業(yè)化、市場化的大規(guī)模制種。


基因編輯



主效QTL定位

采用極端單株池進(jìn)行基因定位,根據(jù)要定位的目標(biāo)性狀,分別提取等量組織(葉片)抽取DNA,用于芯片檢測。


基因精細(xì)定位和克隆

根據(jù)基因初定位結(jié)果,篩選重組單株,對基因進(jìn)行精細(xì)定位。


功能基因鑒定

挑選代表性的單株進(jìn)行基因芯片分析,通過基因區(qū)段及基因功能標(biāo)記,進(jìn)行功能鑒定。



純合度、指紋檢測/遺傳連鎖圖譜構(gòu)建

抽取種子或葉片,混合抽提DNA作芯片檢測,對單個(gè)樣品進(jìn)行基因型分析,并對群體進(jìn)行遺傳連鎖圖譜構(gòu)建。


優(yōu)勢預(yù)測/種質(zhì)資源分類

抽取種子或葉片,混合抽提DNA作芯片檢測,對種質(zhì)進(jìn)行基因型鑒定和聚類分析。


定向改良新品種培育/定

利用基因編輯進(jìn)行品種定向改良和新品種培育,利用單基因品系培育動態(tài)多系品種和特優(yōu)品種。

基因編輯優(yōu)勢 

1.基因定位精準(zhǔn)

遺傳背景標(biāo)記和功能基因標(biāo)記等多態(tài)性標(biāo)記讓基因精細(xì)定位更精準(zhǔn)。

2.檢測基因數(shù)目多檢測位點(diǎn)數(shù)量大

數(shù)以萬計(jì)的有效基因標(biāo)記庫源數(shù)據(jù)分析,保證基因測序質(zhì)量高、吻合度高,優(yōu)化種質(zhì)分類。

3.定制化改良和培育

專屬定制化服務(wù),利用基因編輯進(jìn)行品種定向改良和新品種培育。

4.育種時(shí)間大幅縮短

通過基因編輯篩選培育的植株,可將育種時(shí)間從8~10年縮短至2~3年。


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